Definir lo que es ciencia marginal puede plantear algunas dificultades. Hay una serie de creencias consideradas científicas – astrología, abducción de OVNIs, ESP, levitación – pero su falta de pruebas científicas rigurosas las clasifica como pseudociencia. La ciencia marginal mira a menudo ideas extrañas y lejanas en estudios ya establecidos. Sin embargo, a diferencia de la pseudociencia, la ciencia marginal se conduce por sí misma usando el método científico. Las ideas estudiadas por los científicos marginales no reciben el apoyo de la corriente principal.
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